آزمایشگاه فارماکوگنوزی با مساحت 120 متر مربع در ضلع غربی طبقه سوم دانشکده داروسازی واقع شده است و  دارای دستگاه TLC، روتاری، HPLC و ... و تجهیزات  روتین آزمایشگاهی می باشد.